Los socios son fundamentales para un Centro Nacional de Datos Oceanográficos. Proporcionan la capacidad de observación, invierten en la toma de datos, instrumentación, laboratorios, etc., para diferentes fines y los aplican para beneficio del país. Desde su creación en 1974, el Centro Colombiano de Datos Oceanográficos es financiado por la Dirección General Marítima (Dimar) y sus centros de investigaciones son los principales socios y participantes. Recientemente se vinculó la Red de Medición de Parámetros Oceanográficos y de Meteorología Marina (RedMpomm) y la Infraestructura de Datos Espaciales (IDE) Marítima, Fluvial y Costera.